日本商标申请费用是指在向日本专利商标局(JPO)提交商标注册申请时需要支付的各种费用。这些费用包括官方费用和代理机构费用，具体如下：

1. 官方费用

日本专利商标局的官方费用包括以下几个方面：

(1)商标申请费：根据不同的商品或服务分类，商标申请费不同。一般来说，一个商标的申请费用在5000日元到100000日元之间不等。

(2)商标审查费：商标申请提交后，需要进行审查。审查费用根据不同的商品或服务分类而有所不同。一般来说，一个商标的审查费用在30000日元到1000000日元之间不等。

(3)公告费：如果商标申请被批准，申请人需要支付公告费。公告费根据不同的商品或服务分类而有所不同。一般来说，一个商标的公告费在5000日元到100000日元之间不等。

(4)领证费：如果商标申请被批准，申请人需要支付领证费。领证费根据不同的商品或服务分类而有所不同。一般来说，一个商标的领证费在3000日元到10000日元之间不等。

总的来说，一个商标的官方费用大约在8500日元到165000日元之间不等。

1. 代理机构费用

如果您选择通过代理机构来申请日本商标，那么您需要支付代理机构的费用。代理机构的费用因代理机构的不同而有所不同，一般包括以下几个方面：

(1)代理费：代理机构会根据商标申请的复杂程度和时间等因素来收取代理费。一般来说，一个商标的代理费用在5万日元到20万日元之间不等。

(2)咨询费：如果您需要代理机构提供咨询服务，那么您还需要支付咨询费用。一般来说，一个商标的咨询费用在5万日元到20万日元之间不等。

总的来说，一个商标的代理机构费用大约在10万日元到40万日元之间不等。

需要注意的是，如果您选择自己直接向日本专利商标局提交商标注册申请，那么您不需要支付任何代理机构的费用。但是，由于日本专利商标局的官方网站并不是很友好，因此如果您不熟悉相关的法律规定和程序，可能会导致您的申请被驳回或者延误申请进程。建议您还是选择通过专业的代理机构来申请日本商标。